Após fazer o processo de substituição de documentos, eu incluo desconto/ acréscimo no documento substituído ou substituto?
Após o processo de inclusão e substituição de um documento no CPG, o campo de Desconto/ Acréscimo só habilitará no documento de origem, ou seja, no substituído que pode ser alterado através do menu "Procedimentos Diários > Documentos > Alteração".
Caso os campos não habilitem é necessário alterar a permissão de usuário em "Cadastros > Parâmetros" aba "Dados Gerais" sub-aba "Autorização para usuários".
Cadastros > Parâmetros
Ainda no cadastro de parâmetros aba Dados Gerais sub-aba Opções é preciso marcar a flag "Permite alterar os valores de desconto e acréscimo dos documentos substituídos", para que o boleto de substituição seja atualizado após inserir os valores no documento original.
Cadastros > Parâmetros 
Automaticamente após a alteração o documento de substituição irá atualizar-se.
Em caso de dúvidas, favor abrir um ticket no portal do cliente através do link http://portaldocliente.praxio.com.br para que possamos esclarecê-la.